Esta ermida localiza-se no cimo do Monte da Ajuda, no lado poente voltada para a vila de Santa Cruz. Este templo foi edificado em meados do século XVI, posterior à Ermida de Nossa Senhora da Ajuda, para albergar a irmandade dos mancebos. Encontram-se aqui duas imagens que deram nome a esta ermida, no retábulo do altar: S. João Batista e S. João Evangelista. Ainda que a ermida tenha o duplo orago, só se celebra festa no dia de São João Batista, a 24 de junho.