Foi edificada em 1570, por ordem do Cardeal D. Henrique, sobre a anterior igreja paroquial construída nos inícios do povoamento (a partir de 1460/1470). Nela está sepultado entre outros, o provedor das Armadas Pero Anes do Canto. De estilo renascentista, foi seu mestre de obras Luís Gonçalves. Voltada a Norte, contraria o costume antigo das igrejas com capela-mor virada a Jerusalém. Do altar-mor conservam-se os painéis da vida de Cristo (pintura sobre madeira do séc. XVI), além disso a estante de leitura ao estilo indo-português, em jacarandá do Brasil com marfim de baleia, e executada nos Açores é um testemunho valioso dos Açores como pólo de encontros de culturas.