A primitiva capela de Nossa Senhora da Guia, foi fundada em finais do séc. XV (que hoje está desaparecida). Está anexa ao Edifício de São Francisco, e é um exemplo daquilo a que George Kubler chamou de estilo chão (plain style), que se refere ao estilo arquitetónico português marcado pela austeridade das formas. Aqui foram sepultados Paulo da Gama (irmão de Vasco da Gama), que faleceu no regresso da primeira viagem à Índia, e ainda o Capitão Vaz Corte-Real.