Abriu em 1986, na freguesia dos Flamengos, mais precisamente na Quinta de São Lourenço, local de uma antiga exploração agrícola. Está localizado a cerca de 2 km da cidade da Horta, tem uma área total de 5600 m2 e está vocacionado para a conservação da diversidade biológica. Além de um espaço onde existe toda a flora natural do arquipélago, dá a conhecer algumas plantas medicinais, tradicionalmente utilizadas na região, bem como as suas propriedades. A área do jardim está dividida de acordo com o tipo de flora: uma é destinada à flora natural e endémica dos Açores, por sua vez subdividida em quatro zonas - a costeira, a de média altitude, a de altitude e, por último, uma zona para plantas que necessitam de abrigo. Numa outra área pode-se encontrar o banco de sementes de plantas dos Açores, um viveiro de plantas endémicas e o Orquidário.