As Caldeiras Funda e Rasa, localizadas no setor sul do planalto central da ilha das Flores, estão associadas a erupções hidro magmáticas, ou seja, erupções em que o magma ao ascender contacta com água, dando origem a uma atividade explosiva. Em ambas as depressões existem lagoas que, apesar da sua proximidade, encontram-se a cotas diferentes (de 360 m no caso da lagoa da Caldeira Funda e de 530 m no caso da lagoa da Caldeira Rasa), tendo em conta que no primeiro caso a massa de água ocupa o fundo de uma cratera de explosão do tipo maar, enquanto que a lagoa da Caldeira Rasa está instalada num anel de tufos.