Estas estruturas vulcânicas localizam-se no Planalto Central da ilha das Flores e constituem crateras de explosão denominadas de maars, associadas a erupções hidro magmáticas nas quais o magma em ascensão contacta com água, originando uma atividade explosiva e a formação destas depressões. Na Caldeira Negra, a profundidade da massa de água atinge 108 m (a mais profunda dos Açores), o que também justifica a designação de Caldeira Funda. Em todo o geossítio é possível desfrutar das bonitas panorâmicas que esta geopaisagem oferece, quer junto às crateras, quer do cimo do Morro Alto.